Prediksi Interaksi Antigen NS1 DENV-1 dan DENV-2 Indonesia terhadap Antibodi melalui Homology Modeling dan Molecular Docking

DEWI ASTRIANY, - and HERMAN SUSANTO, - and MUHAMMAD YUSUF, - (2019) Prediksi Interaksi Antigen NS1 DENV-1 dan DENV-2 Indonesia terhadap Antibodi melalui Homology Modeling dan Molecular Docking. In: Seminar Nasional Kimia 2019, 27 April 2019, Universitas Padjadjaran.

Text view_usp=drive_link - Published Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial No Derivatives. Download (94kB)

Abstract

Demam Berdarah Dengue merupakan penyakit yang disebabkan oleh virus dengue (DENV) yang ditransmisikan melalui nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus. Terdapat empat serotipe virus dengue yang telah dikenal secara luas yaitu DENV-1, DENV-2, DENV-3, dan DENV-4. Genom virus dengue tersusun atas tiga gen struktural (mengkodekan protein C, prM/M, dan E) serta tujuh gen non-struktural (mengkodekan protein NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, dan NS5). Antigen NS1 yang dikodekan oleh virus telah menjadi salah satu dasar perangkat pilihan dalam tes diagnostik laboratorium. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi interaksi antara antigen DENV-1 dan DENV-2 Indonesia terhadap antibodi spesifik melalui Homology Modeling dan Molecular Docking. Pendekatan in silico dilakukan melalui pencarian templat yang memiliki tingkat homologi tinggi dengan urutan asam amino NS1 Indonesia menggunakan BLAST dan Phyre2. Homology Modeling terhadap 21 antigen NS1 Indonesia serotipe DENV-1 dan 7 antigen NS1 Indonesia serotipe DENV-2 dengan templat 4O6B_A dilakukan menggunakan aplikasi Modeller 9.19. Profil hasil Molecular Docking model terpilih dengan fragmen antibodi spesifik ditunjukkan dengan nilai RMSD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai RMSD untuk model DENV-1 adalah 25,569 Å dan untuk model DENV-2 adalah 23,151 Å.

Item Type:	Conference or Workshop Item (Speech)
Uncontrolled Keywords:	virus dengue, antigen NS1, homology modeling, molecular docking
Subjects:	Q Science > QD Chemistry
Divisions:	Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat > Publikasi Penelitian
Depositing User:	- Dewi Astriany -
Date Deposited:	20 Aug 2024 04:21
Last Modified:	20 Aug 2024 04:21
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/988

Actions (login required)

View Item