PENCARIAN LOKASI DAN DESAIN PRIMER GEN BIOSURFAKTAN PADA BAKTERI Bacillus cereus DAN Brevundimonas spp. MENGGUNAKAN METODE BIOINFORMATIKA

DEBORA WATI, - (2021) PENCARIAN LOKASI DAN DESAIN PRIMER GEN BIOSURFAKTAN PADA BAKTERI Bacillus cereus DAN Brevundimonas spp. MENGGUNAKAN METODE BIOINFORMATIKA. Skripsi thesis, Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia.

	Text S_PSSF_A172004_Title.pdf Download (4MB)
	Text S_PSSF_A172004_Chapter1.pdf Restricted to Repository staff only Download (971kB)
	Text S_PSSF_A172004_Chapter2.pdf Restricted to Repository staff only Download (5MB)
	Text S_PSSF_A172004_Chapter3.pdf Restricted to Repository staff only Download (662kB)
	Text S_PSSF_A172004_Chapter4.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB)
	Text S_PSSF_A172004_Chapter5.pdf Restricted to Repository staff only Download (558kB)
	Text S_PSSF_A172004_Appendix.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Biosurfaktan merupakan senyawa permukaan aktif yang dihasilkan oleh mikroba yang bersifat biodegradable dan menggunakan sumber yang dapat diperbaharui. Produksi biosurfaktan skala industri masih belum maksimal karena produktivitasnya yang rendah. Dengan mengetahui genetika penghasil biosurfaktan dari suatu mikroba diharapkan dapat meningkatkan produksi biosurfaktan. Pada penelitian ini dilakukan analisis bioinformatika untuk mengetahui jenis, lokasi dan desain primer gen biosurfaktan pada bakteri Bacillus cereus dan Brevundimonas spp. Sekuen dari genom bakteri dan gen biosurfaktan dianalisis pada program Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) untuk mengetahui tingkat kesamaan dari kedua sekuen tersebut. Analisis penyelarasan antara genom bakteri dengan sekuen nukleotida biosurfaktan diperoleh hasil yang signifikan pada enam jenis biosurfaktan pada bakteri Bacillus cereus MGJa3, Bacillus cereus galur DLOU-Changhai dan Bacillus cereus galur TG1-6, sedangkan pada penyelarasan dengan sekuen protein biosurfaktan hasil yang signifikan diperoleh pada tiga belas jenis biosurfaktan pada bakteri Bacillus cereus galur MBGJa3 dan Brevundimonas nasdae galur A30. Primer dirancang menggunakan Primer-BLAST kemudian dari kesepuluh kandidat primer yang diperoleh pada masing-masing gen dipilih satu primer dengan karakteristik terbaik. Primer yang didesain akan menghasilkan amplikon sebesar 887 pasang basa untuk surfaktin, 897 pasang basa untuk iturin dan 808 pasang basa untuk fengycin.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Uncontrolled Keywords:	biosurfaktan, bioinformatika, penyelarasan sekuen, BLAST
Subjects:	Q Science > Q Science (General) Q Science > QR Microbiology
Divisions:	Program Studi S1 Farmasi
Depositing User:	pustakawan - -
Date Deposited:	27 Jul 2024 02:04
Last Modified:	27 Jul 2024 02:04
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/752

Actions (login required)

View Item