DESAIN DNA PRIMER SPESIFIK SECARA IN SILICO MENGGUNAKAN PRIMER BLAST NCBI PADA HEWAN ULAR SEBAGAI KOMPONEN PCR

YULIA SAPARINA ANJANI A 162 013, - (2020) DESAIN DNA PRIMER SPESIFIK SECARA IN SILICO MENGGUNAKAN PRIMER BLAST NCBI PADA HEWAN ULAR SEBAGAI KOMPONEN PCR. Skripsi thesis, Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia.

	Text S_PSSF_A162013_Title.pdf Download (249kB)
	Text S_PSSF_A162013_Chapter1.pdf Restricted to Repository staff only Download (102kB)
	Text S_PSSF_A162013_Chapter2.pdf Restricted to Repository staff only Download (204kB)
	Text S_PSSF_A162013_Chapter3.pdf Restricted to Repository staff only Download (147kB)
	Text S_PSSF_A162013_Chapter4.pdf Restricted to Repository staff only Download (260kB)
	Text S_PSSF_A162013_Chapter5.pdf Restricted to Repository staff only Download (64kB)
	Text S_PSSF_A162013_Appendix.pdf Restricted to Repository staff only Download (156kB)

Abstract

Suatu produk yang halal menjadi kebutuhan wajib bagi para konsumen yang beragama islam. Produk halal dapat berupa makanan, obat-obatan, dan barangbarang lain yang dikonsumsi. Pasar Indonesia menjadi pasar konsumen muslim yang sangat besar, karena hal itu, jaminan akan produk halal menjadi suatu hal yang penting untuk mendapatkan perhatian. Penetapan kehalalan produk dilakukan oleh MUI. Parameter kehalalan produk di MUI hanya dilakukan pengecekan terhadap babi saja. Sedangkan banyak hadits yang menyebutkan bahwa yang haram bukan babi saja, salah satunya hewan bertaring seperti Ular. Oleh karena itu perlu adanya deteksi produk halal yang bisa dilakukan dengan PCR. PCR membutuhkan DNA Primer, sehingga dilakukan desain DNA primer. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui rancangan dan urutan DNA primer spesifik yang optimal pada hewan ular. Metode penelitian dilakukan dengan pencarian data genom dari GenBank NCBI, kemudian dipilih daerah conserved melalui Allignment Analysis menggunakan MEGAX, kemudian di desain melalui Primer BLAST NCBI dan dipilih DNA primer spesifik yang optimal yang dipilih melalui metode scorring. Hasil yang didapat adalah sepasang DNA primer yang spesifik untuk ular yaitu Forward primer 5’ CTTCTACACAACGAAGGGTC 3’ dan Reverse primer 5’ AGAAGTTTTCTGGGTCGTTG 3’dengan gen cytochrome B. ---- A halal product is a mandatory needs for Muslim consumers. It can be in the form of food, medicines, and other items that are consumed. The Indonesian market is a very large Muslim consumer market, because of this, guaranteeing halal products is an important thing to get attention. The institution that determines the halalness of a product is MUI. The parameter of product halalness at MUI is only checked for pigs. Meanwhile, many hadits say that the haram product is not only pig,but also one fanged animals such as dogs and snakes. Therefore, it is necessary to detect halal products that can be carried out by PCR. PCR requires primary DNA, so primary DNA design is carried out. The purpose of this research was to determine the optimal design and specific primary DNA sequence in snakes. The research method was carried out by searching for genomic data from GenBank NCBI, conserved areas then was selected through Allignment Analysis using MEGAX, then designied by NCBI BLAST Primer and optimal specific primary DNA selected by the scorring method. The results obtained were a pair of specific DNA primer for snake is Forward primer 5’ CTTCTACACAACGAAGGGTC 3’ and Reverse primer AGAAGTTTTCTGGGTCGTTG 3’ with the cytochrome B gene.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Uncontrolled Keywords:	DNA primer, Primer BLAST NCBI, MEGAX, Ular.---- Primary DNA, Primer BLAST NCBI, MEGAX, Snake.
Subjects:	Q Science > Q Science (General)
Divisions:	Program Studi S1 Farmasi
Depositing User:	pustakawan - -
Date Deposited:	02 Oct 2024 02:36
Last Modified:	02 Oct 2024 02:36
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/1385

Actions (login required)

View Item