KONSTRUKSI GEN FENGYCIN DARI BAKTERI Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 PADA PLASMID PPICZa

DESTYA OCKTAVIANI, - (2022) KONSTRUKSI GEN FENGYCIN DARI BAKTERI Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 PADA PLASMID PPICZa. Skripsi thesis, Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia.

	Text S_PSSF_A182010_Title.pdf Download (3MB)
	Text S_PSSF_A182010_Chapter1.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	Text S_PSSF_A182010_Chapter2.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)
	Text S_PSSF_A182010_Chapter3.pdf Restricted to Repository staff only Download (502kB)
	Text S_PSSF_A182010_Chapter4.pdf Restricted to Repository staff only Download (3MB)
	Text S_PSSF_A182010_Chapter5.pdf Restricted to Repository staff only Download (239kB)
	Text S_PSSF_A182010_Appendix.pdf Restricted to Repository staff only Download (608kB)

Abstract

Salah satu biosurfaktan golongan lipopeptida yaitu fengycin, kelompok lipopeptida termasuk biosurfaktan yang paling popular. Fengycin memiliki sifat antijamur yang kuat. Fengycin digunakan dalam penelitian ini sebagai gen target dengan mendapatkan urutan asam amino dari PDB, asam amino yang didapat kemudian ditranslasi balik menggunakan reverse translate menjadi DNA. Hasil dari translasi balik kemudian dilakukan pengecekkan kesesuaian kodon gen fengycin tersebut dengan Pichia pastoris, karena proses ekspresi akan dilakukan pada inang Pichia pastoris. Setelah kodon tersebut sesuai selanjutnya dianalisis enzim restriksi yang ada pada gen target menggunakan software NEBcutter dengan tujuan mengetahui enzim restriksi yang dapat memotong suatu DNA target dan analisis enzim restriksi pada plasmid PPICZa dilakukkan menggunakan aplikasi google dengan pencarian peta plasmid pPICZa. Desain primer dilakukkan untuk mengetahui primer reverse dan primer forward yang akan digunakan dalam penelitian ini. Analisis hasil yang didapat dapat dilihat dari kesesuaian urutan asam amino yang dapat dilihat dari inframe. Hasil dari penelitian ini bahwa gen target fengycin dapat diperbanyak dengan menggunakan enzim yang digunakan pada konstruksi gen fenycin pada plasmid PPICZa yaitu EcoRI dan Notl, dengan menggunakan enzim tersebut menyebabkan terligasinya tanpa ada perubahan pada asam amino gen fengycin yang dapat diekspresikan pada Pichia pastoris dan primer yang digunakan primer forward 5'-GAATTCATGGAATTTTGTCATTTT-3 dan primer reverse 5- TGGCGGCCGCCTCAATGATGATGATGATG-3'. ---- One of the biosurfactants of the lipopeptide group is fengycin, the lipopeptide group is the most popular biosurfactant. Fengycin has strong antifungal properties. Fengycin was used in this study as a target gene by obtaining the amino acid sequence from PDB, the amino acid obtained was then reverse translated using reverse translate into DNA. The results of the reverse translation were then checked for the suitability of the codon of the fengycin gene with Pichia pastoris, because the expression process will be carried out on the host of Pichia pastoris. After the codons are matched, the restriction enzymes present in the target gene are analyzed using NEBcutter software with the aim of knowing the restriction enzymes that can cut a target DNA and analysis of the restriction enzymes on the PPICZa plasmid was carried out using the google application by searching for the pPICZa plasmid map. The primary design was carried out to determine the reverse primer and forward primer that will be used in this study. Analysis of the results obtained can be seen from the suitability of the amino acid sequence that can seen from the inframe. The results of this study were that the fengycin target gene could be propagated by using the enzyme used in the construction of the fenycin gene on the PPICZa plasmid, namely EcoRI and Notl, using these enzymes to cause ligation without any change in the amino acids of the fengycin gene that could be expressed in Pichia pastoris and primers that used a forward primer 5'- GAATTCTACTACCGTCGCGCCAATAC-3' and a reverse primer 5'- GCGGCCGC GCTGCGCTACATTCTCGTTG-3'.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Uncontrolled Keywords:	Fengycin, pPICZa, lipopeptida, DNA rekombinan. ---- Fengycin, pPICZa, lipopeptide, recombinant DNA.
Subjects:	Q Science > Q Science (General)
Divisions:	Program Studi S1 Farmasi
Depositing User:	pustakawan - -
Date Deposited:	14 Sep 2024 14:34
Last Modified:	14 Sep 2024 14:34
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/1241

Actions (login required)

View Item