STUDI SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL PADA SENYAWA BRAZILIN SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA

JASMINE AULIYA DASILVA, - (2024) STUDI SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL PADA SENYAWA BRAZILIN SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA. Skripsi thesis, Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia.

	Text S_PSSF_A201016_Title.pdf Download (1MB)
	Text S_PSSF_A201016_Chapter1.pdf Restricted to Repository staff only Download (339kB)
	Text S_PSSF_A201016_Chapter2.pdf Restricted to Repository staff only Download (584kB)
	Text S_PSSF_A201016_Chapter3.pdf Restricted to Repository staff only Download (341kB)
	Text S_PSSF_A201016_Chapter4.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	Text S_PSSF_A201016_Chapter5.pdf Restricted to Repository staff only Download (330kB)
	Text S_PSSF_A201016_Appendix.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Kanker payudara merupakan salah satu kanker yang berkontribusi terhadap prevalensi kanker pada wanita di dunia termasuk di Indonesia yang ditandai pertumbuhan sel yang tidak normal dan tidak terkendali. Kayu secang (Caesalpinia sappan L.) adalah salah satu tanaman yang digunakan untuk pengobatan tradisional. Di dalam kayu secang terdapat senyawa brazilin yang dapat mempunyai aktivitas sebagai antikanker payudara. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui kestabilan interaksi antara senyawa brazilin dengan berbagai reseptor target yaitu estrogen alfa, 17-β-HSD-1 , dan NUDT5, serta dapat menjadi kandidat antikanker payudara melalui simulasi dinamika molekul. Hasil simulasi selama 100 ns menunjukkan bahwa ligan brazilin memiliki performa unggul dalam beberapa parameter, terutama dengan reseptor estrogen alfa. Interaksi brazilin dengan reseptor estrogen alfa terlihat dari persen okupansi sebesar 97,8% pada GLU 48 dan nilai rata-rata RMSD ligan sebesar 0,2 Å, yang lebih rendah dibandingkan dengan reseptor lainnya. Meskipun ligan bawaan OHT pada reseptor estrogen alfa lebih stabil dengan nilai MMGBSA yang lebih rendah (-54,2799 kkal/mol), brazilin tetap menunjukkan stabilitas dan interaksi yang kuat. Hal ini menandakan bahwa senyawa brazilin dapat dijadikan sebagai kandidat antikanker payudara, meskipun diperlukan optimasi lebih lanjut untuk meningkatkan afinitas pengikatannya. ---- Breast cancer is one of the cancers that contributes to the prevalence of cancer in women in the world including in Indonesia which is characterized by abnormal and uncontrolled cell growth. Secang wood (Caesalpinia sappan L.) is one of the plants used for traditional medicine. In secang wood there’s a brazilin compound that can have activity as an anti-breast cancer. The purpose of this study was to determine the stability of the interaction between the brazilin compound and various target receptors, namely estrogen alpha, 17-β-HSD-1, and NUDT5, and can be a candidate for anti-breast cancer through molecular dynamics simulations. The simulation results for 100 ns showed that the brazilin ligand had superior performance in several parameters, especially with the estrogen alpha receptor. The interaction of brazilin with the estrogen alpha receptor can be seen from the occupancy percentage of 97.8% at GLU 48 and the average ligand RMSD value of 0.2 Å, which is lower than other receptors. Although the native ligand OHT on estrogen receptor alpha is more stable with a lower MMGBSA value (-54.2799 kcal/mol), brazilin still shows stability and strong interaction. This indicates that the brazilin compound can be used as a candidate for breast cancer, although further optimization is needed to increase its binding affinity.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Uncontrolled Keywords:	Brazilin, simulasi dinamika molekul, reseptor, kanker payudara. ----- Brazilin, molecular dynamics simulation, receptor, breast cancer
Subjects:	Q Science > QD Chemistry R Medicine > R Medicine (General)
Divisions:	Program Studi S1 Farmasi
Depositing User:	pustakawan - -
Date Deposited:	26 Aug 2024 07:30
Last Modified:	26 Aug 2024 07:30
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/1065

Actions (login required)

View Item