STUDI SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL PADA SENYAWA ANDROGRAFOLID SEBAGAI ANTIKANKER PARU

NISRINA AURA KHOLILAH, - (2024) STUDI SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL PADA SENYAWA ANDROGRAFOLID SEBAGAI ANTIKANKER PARU. Skripsi thesis, Sekolah Tinggi Farmasi Indonesia.

	Text S_PSSF_A201054_Title.pdf Download (381kB)
	Text S_PSSF_A201054_Chapter1.pdf Restricted to Repository staff only Download (44kB)
	Text S_PSSF_A201054_Chapter2.pdf Restricted to Repository staff only Download (220kB)
	Text S_PSSF_A201054_Chapter3.pdf Restricted to Repository staff only Download (43kB)
	Text S_PSSF_A201054_Chapter4.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	Text S_PSSF_A201054_Chapter5.pdf Restricted to Repository staff only Download (29kB)
	Text S_PSSF_A201054_Appendix.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Kanker masih merupakan penyebab kematian paling umum di seluruh dunia. Pada tahun 2020, ada sekitar 19,3 juta kasus kanker baru. Angka insiden kanker dan kematian telah meningkat secara eksponensial. Salah satu jenis kanker yang paling ganas adalah kanker paru, yang mencapai 13% dari semua diagnosis kanker. Andrografolid merupakan komponen bioaktif utama tanaman obat sambiloto yang dianggap memiliki efek antikanker. Untuk melihat potensi andrografolid sebagai antikanker, diperlukan informasi mengenai kestabilan konformasi struktur reseptor EGFR, PDGFR, dan PD-L1, dengan parameter nilai RMSD, RMSF, MM/GBSA, dan ikatan hidrogen yang terbentuk selama interaksi dengan senyawa andrografolid, menggunakan metode simulasi dinamika molekul. Simulasi dinamika molekul dilakukan menggunakan perangkat lunak AMBER, yang mencakup modul-modul seperti antechamber, parmchk, leap, pmemd, dan cpptraj. Simulasi dinamika molekul pada penelitian ini dilakukan selama 100 ns untuk melihat kestabilan interaksi ligan-reseptor yang terbentuk dalam suhu fisiologis tubuh yaitu 37°C. Hasil penelitian menunjukkan bahwa andrografolid mampu berinteraksi dengan ketiga reseptor target, dengan nilai afinitas yang mengindikasikan potensi penghambatan. Interaksi ini melibatkan ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik, yang berkontribusi pada stabilitas kompleks liganreseptor. Kesimpulan yang diperoleh dari hasil simulasi dinamika molekul menunjukan bahwa andrografolid memiliki potensi sebagai antikanker paru, namun dari empat parameter yang diujikan, ligan standar memiliki nilai yang lebih baik dibandingkan dengan molekul andrografolid. Penelitian ini memberikan dasar untuk pengembangan lebih lanjut senyawa andrografolid dalam terapi kanker paru. ---- Cancer is still the most common cause of death worldwide. In 2020, there were an estimated 19.3 million new cancer cases. Cancer incidence and mortality rates have increased exponentially. One of the most virulent types of cancer is lung cancer, which accounts for 13% of all cancer diagnoses. Andrographolide is the main bioactive component of the medicinal plant sambiloto which is thought to have anticancer effects. To see the potential of andrografolid as an anticancer, information is needed regarding the conformational stability of EGFR, PDGFR, and PD-L1 receptor structures, with parameters of RMSD, RMSF, MM/GBSA, and hydrogen bonds formed during interactions with andrografolid compounds, using molecular dynamics simulation methods. Molecular dynamics simulations were performed using AMBER software, which includes modules such as antechamber, parmchk, leap, pmemd, and cpptraj. The molecular dynamics simulation in this study was carried out for 100 ns to see the stability of the ligand-receptor interaction formed in the physiological body temperature of 37°C. The results showed that andrographolide was able to interact with all three target receptors, with affinity values indicating inhibitory potential. This interaction involves hydrogen bonding and hydrophobic interactions, which contribute to the stability of the ligand-receptor complex. The conclusion obtained from the molecular dynamics simulation results shows that andrographolide has potential as a lung anticancer, but of the four parameters tested, the standard ligand has a better value than the andrografolid molecule. This study provides a basis for further development of andrographolide compounds in lung cancer therapy.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Uncontrolled Keywords:	Kanker paru, antikanker paru, andrografolid, simulasi dinamika molekul, AMBER. ---- Lung cancer, lung anticancer, andrographolide, molecular dynamics simulation, AMBER.
Subjects:	Q Science > QD Chemistry R Medicine > R Medicine (General)
Divisions:	Program Studi S1 Farmasi
Depositing User:	pustakawan - -
Date Deposited:	26 Aug 2024 03:41
Last Modified:	26 Aug 2024 03:41
URI:	http://repository.stfi.ac.id/id/eprint/1053

Actions (login required)

View Item